La struttura didattica dell'IITM è organizzata in Scuole che propongono corsi e moduli didattici specifici. In totale sono state attivate 5 scuole la cui direzione è affidata ad un docente capofila:

1) Scuola di Sound Designing: si occupa della formazione di professionisti che si occupano della realizzazione di suoni a supporto dell'industria musicale, broadcast e dell'intrattenimento.

2) Scuola di Sound Engineering: è stata creata per la formazione dei tecnici del suono che manipolano tecnologie digitali, virtuali, analogiche per la realizzazione di produzioni musicali in studio o live.

3) Scuola di Musica Elettronica: offre una formazione ampia sulle tecnologie e metodologie per consentire ad un allievo di progettare e realizzare performance e live elettroniche, installazioni sonore e produzioni musicali contando sia su aspetti commerciali che accademici.

4) Scuola di Composizione applicata ed Orchestrazione virtuale: consigliata a chi vuole intraprendere la professione relativa alla creazione della colonna sonora di film, cortometraggi, pubblicità sfruttando le ultime tecnologie in ambito di orchestrazione virtuale. E' la scuola che offre il maggior numero di moduli didattici vista la ampia utilizzazione di tecnologia e i numerosi campi di attuazione.

5) Scuola di Produzione, Musica e Tecnologia: si rivolge a musicisti che cercano una specializzazione ed un perfezionamento nella tecnica e prassi esecutiva e che vogliono acquisire un livello di eccellenza nell'utilizzo di tecnologia per migliorare le proprie produzioni musicali o per contribuire significatamente a quelle di altri professionisti. Anche i principianti possono intraprendere un percorso professionale potenziando però gli aspetti di teoria musicale e prassi esecutiva.